DSpace Collection:https://repositorio.unemi.edu.ec/xmlui/handle/123456789/71892026-06-13T14:57:20Z2026-06-13T14:57:20ZReacción en Cadena de la Polimerasa PCR de dos rondas con reamplificación desde gel para detectar dirofilaria immitis en perros de El Oro EcuadorAguilar Gálvez, Fernando Leninhttps://repositorio.unemi.edu.ec/xmlui/handle/123456789/88392026-06-03T19:49:27Z2026-01-01T00:00:00ZTitle: Reacción en Cadena de la Polimerasa PCR de dos rondas con reamplificación desde gel para detectar dirofilaria immitis en perros de El Oro Ecuador
Authors: Aguilar Gálvez, Fernando Lenin
Abstract: La dirofilariosis cardiopulmonar por Dirofilaria immitis es una zoonosis transmitida por mosquitos que afecta a perros en regiones tropicales su diagnóstico exige integrar pruebas serológicas y moleculares para evitar sobre o subestimaciones Este estudio tuvo como objetivo detectar molecularmente D immitis en perros de la provincia de El Oro Ecuador mediante PCR punto final del gen COI y confirmar la identidad por secuenciación incorporando una ruta de re amplificación cuando aparecieron dímeros o bandas inespecíficas Se realizó un estudio observacional descriptivo y transversal con enfoque cuantitativo en 40 caninos con signos compatibles evaluados mediante inmunocromatografía IC los IC positivos se retestearon y pasaron a PCR amplicón ~150 pb Cuando la primera ronda mostró perfiles subóptimos purificamos la banda específica en gel y realizamos una segunda PCR con los mismos cebadores dos rondas no anidada Los productos positivos se secuenciaron en doble dirección La IC fue positiva en 24 40 60 0% La PCR confirmó D immitis en 10 24 IC+ 41 7% y no detectó en 14 24 58 3% La positividad por PCR se concentró en Machala 6 casos seguida de Santa Rosa 3 casos y Huaquillas 1 caso El análisis estadístico sugirió diferencias en la distribución de casos positivos entre cantones χ² = 15 27 p = 0 00048 sin embargo este hallazgo debe interpretarse con cautela debido al tamaño muestral limitado y a la distribución desigual de la muestra entre jurisdicciones La re amplificación desde banda purificada resolvió dímeros inespecificidad y permitió obtener amplicones aptos para secuenciación Concluimos que la serología aislada sobreestima la ocurrencia la PCR con re amplificación incrementa la especificidad y la certeza diagnóstica Un algoritmo escalonado IC + microfilarias → PCR con re amplificación cuando aplique → secuenciación optimiza el diagnóstico y la vigilancia de la dirofilariosis canina en El Oro2026-01-01T00:00:00ZDesarrollo y evaluación de un pipeline en R para análisis metagenómico de secuencias ITS de IlluminaTamayo Cevallos, Ricardo Andreshttps://repositorio.unemi.edu.ec/xmlui/handle/123456789/87702026-05-19T21:37:51Z2026-01-01T00:00:00ZTitle: Desarrollo y evaluación de un pipeline en R para análisis metagenómico de secuencias ITS de Illumina
Authors: Tamayo Cevallos, Ricardo Andres
Abstract: La caracterización de la diversidad fúngica mediante métodos tradicionales presenta
limitaciones significativas acentuadas por la barrera técnica que supone el análisis
bioinformático de datos de secuenciación masiva Este estudio tuvo como objetivo
desarrollar y validar un pipeline bioinformático reproducible en R para el análisis
metagenómico de secuencias de la región ITS fúngica generadas por Illumina La
metodología implementada integró herramientas estandarizadas DADA2 phyloseq
para el control de calidad inferencia de Variantes de Secuencia de Amplicón ASVs
asignación taxonómica utilizando la base de datos UNITE y análisis de diversidad
alfa y beta Los resultados demostraron la eficacia del pipeline obteniéndose perfiles
de calidad optimizados matrices de ASVs y visualizaciones que revelaron la
composición de las comunidades fúngicas Los análisis ecológicos identificaron a
Ascomycota y Basidiomycota como los filos dominantes y permitieron discernir
patrones significativos en la composición de las comunidades entre muestras Se
concluye que el pipeline desarrollado supera las limitaciones de los métodos
dependientes de cultivo caracterizando eficientemente la materia oscura
microbiana Su diseño accesible y reproducible democratiza el acceso a análisis
metagenómicos robustos constituyendo una herramienta valiosa para aplicaciones
en biotecnología y ecología2026-01-01T00:00:00ZDesarrollo de un protocolo para la regeneración de plantas de Banano Williams (Musa spp.) vía yemas adventicias mediante el uso de medios de cultivo semisólidos y biorreactores de inmersión temporal.Tapay Mendoza, María Inéshttps://repositorio.unemi.edu.ec/xmlui/handle/123456789/87432026-05-12T17:01:22Z2026-01-01T00:00:00ZTitle: Desarrollo de un protocolo para la regeneración de plantas de Banano Williams (Musa spp.) vía yemas adventicias mediante el uso de medios de cultivo semisólidos y biorreactores de inmersión temporal.
Authors: Tapay Mendoza, María Inés
Abstract: En el presente documento se describe un protocolo eficiente de regeneración de plantas in vitro de banano Williams vía yemas adventicias Los diferentes ensayos se llevaron a cabo en el Laboratorio de Biotecnología de la Estación Experimental Litoral Sur EELS del Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuarias INIAP ubicado en el cantón San Jacinto de Yaguachi provincia del Guayas El protocolo se estableció a partir de la evaluación de diferentes concentraciones de Tidiazuron TDZ en medios de cultivo semisólidos y el efecto de diferentes concentraciones de 6 Bencilaminopurina 6BAP en la multiplicación de las yemas adventicias y la regeneración de plantas en biorreactores de inmersión temporal El objetivo final fue desarrollar un protocolo eficiente con la tasa de regeneración de plantas de banano más elevada que las descritas hasta el momento en la literatura internacional contribuyendo así a incrementar la probabilidad de desagregar quimeras con mayor eficiencia en programas de mejoramiento genético con base en la variación somaclonal o la mutagénesis2026-01-01T00:00:00ZUso de biopolímeros para la formación de biofilms protectores contra enfermedades del sistema radicular del bananoHeredia Silva, David Sebastiánhttps://repositorio.unemi.edu.ec/xmlui/handle/123456789/84882026-04-13T17:58:23Z2026-01-01T00:00:00ZTitle: Uso de biopolímeros para la formación de biofilms protectores contra enfermedades del sistema radicular del banano
Authors: Heredia Silva, David Sebastián
Abstract: El cultivo de banano Musa spp variedad Cavendish representa un pilar estratégico para la economía agrícola de varios países tropicales Sin embargo su productividad se ve comprometida por enfermedades del sistema radicular causadas por hongos como Fusarium oxysporum f sp cubense Pythium spp y Rhizoctonia solani Frente a la ineficacia progresiva de agroquímicos esta investigación evaluó el uso de biopolímeros quitosano alginato y exopolisacáridos bacterianos para la formación de biofilms protectores como estrategia sostenible de manejo fitosanitario Se trabajó bajo un diseño experimental completamente aleatorizado con cinco tratamientos aplicados en plantas de banano en vivero Se evaluaron variables microbiológicas fisiológicas y de severidad de enfermedad Los resultados mostraron que el tratamiento combinado de quitosano con EPS redujo significativamente la incidencia de patógenos promovió el desarrollo radicular y favoreció el establecimiento de microorganismos benéficos en la rizósfera La hipótesis fue validada evidenciando el potencial de los biopolímeros como agentes de control biotecnológico para enfermedades radiculares El estudio ofrece una alternativa ecológica viable que puede integrarse en programas de agricultura sostenible especialmente para pequeños productores2026-01-01T00:00:00Z