Abstract:
La caracterización de la diversidad fúngica mediante métodos tradicionales presenta
limitaciones significativas acentuadas por la barrera técnica que supone el análisis
bioinformático de datos de secuenciación masiva Este estudio tuvo como objetivo
desarrollar y validar un pipeline bioinformático reproducible en R para el análisis
metagenómico de secuencias de la región ITS fúngica generadas por Illumina La
metodología implementada integró herramientas estandarizadas DADA2 phyloseq
para el control de calidad inferencia de Variantes de Secuencia de Amplicón ASVs
asignación taxonómica utilizando la base de datos UNITE y análisis de diversidad
alfa y beta Los resultados demostraron la eficacia del pipeline obteniéndose perfiles
de calidad optimizados matrices de ASVs y visualizaciones que revelaron la
composición de las comunidades fúngicas Los análisis ecológicos identificaron a
Ascomycota y Basidiomycota como los filos dominantes y permitieron discernir
patrones significativos en la composición de las comunidades entre muestras Se
concluye que el pipeline desarrollado supera las limitaciones de los métodos
dependientes de cultivo caracterizando eficientemente la materia oscura
microbiana Su diseño accesible y reproducible democratiza el acceso a análisis
metagenómicos robustos constituyendo una herramienta valiosa para aplicaciones
en biotecnología y ecología
