La nomenclatura orgánica según la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada IUPAC constituye un pilar del lenguaje químico y un componente esencial para la comunicación científica en educación superior sin embargo su aprendizaje implica elevada demanda cognitiva debido a la jerarquización normativa la abstracción simbólica y la integración estructural el objetivo general consistió en analizar las concepciones alternativas y los errores conceptuales que presentan los estudiantes de posgrado en el aprendizaje de la nomenclatura orgánica según la normativa IUPAC en la Universidad Estatal de Milagro se adoptó un enfoque cuantitativo con diseño no experimental descriptivo y de corte transversal la muestra estuvo conformada por 57 estudiantes de posgrado de la Universidad Estatal de Milagro que respondieron voluntariamente el cuestionario se aplicó un instrumento estructurado en cuatro dimensiones identificación de la cadena principal asignación de localizadores reconocimiento de grupos funcionales y nomenclatura de compuestos ramificados los resultados evidenciaron un desempeño conceptual intermedio en todas las dimensiones con medias ubicadas en umbral neutral y alta consistencia interna del instrumento α=0981 se identificaron mayores dificultades en procesos que exigen integración jerárquica y toma de decisiones estructurales asimismo se observaron correlaciones elevadas entre dimensiones lo que confirma la naturaleza sistémica del dominio nominativo se concluye que la consolidación del aprendizaje requiere estrategias didácticas orientadas a fortalecer la articulación entre representación molecular y normativa IUPAC